Civilinės metrikacijos skyrius Kultūros paveldo skyrius Kultūros skyrius Socialinės paramos skyrius Socialinių paslaugų skyrius Sporto skyrius Sveikatos apsaugos skyrius Švietimo skyrius Užsienio ryšių skyrius

Bendrųjų reikalų skyrius Centrinis viešųjų pirkimų ir koncesijų skyrius Daugiabučių namų administravimo ir renovavimo skyrius Dokumentų skyrius E. paslaugų ir informacinių technologijų skyrius Energetikos skyrius Klientų aptarnavimo skyrius Viešosios tvarkos skyrius

Seniūnijos Aleksoto seniūnija Centro seniūnija Dainavos seniūnija Eigulių seniūnija Gričiupio seniūnija Panemunės seniūnija Petrašiūnų seniūnija Šančių seniūnija Šilainių seniūnija Vilijampolės seniūnija Žaliakalnio seniūnija

Aplinkos apsaugos skyrius Centralizuotas vidaus audito skyrius Centrinis apskaitos skyrius Finansų ir ekonomikos skyrius Juridinių asmenų valdymo skyrius Miesto planavimo ir architektūros skyrius Miesto tvarkymo skyrius Nekilnojamojo turto skyrius Personalo valdymo skyrius Plėtros programų ir investicijų skyrius Ryšių su visuomene skyrius Statybos valdymo skyrius Teisės ir konsultavimo skyrius Transporto ir eismo organizavimo skyrius