Civilinės metrikacijos skyrius Kultūros skyrius Socialinės paramos skyrius Socialinių paslaugų skyrius Sporto skyrius Sveikatos apsaugos skyrius Švietimo skyrius Vaiko teisių apsaugos skyrius

Aplinkos apsaugos skyrius Energetikos skyrius Kultūros paveldo skyrius Miesto civilinės saugos skyrius Miesto planavimo ir architektūros skyrius Miesto tvarkymo skyrius Statybos valdymo skyrius Transporto ir eismo organizavimo skyrius Viešosios tvarkos skyrius

Aprūpinimo skyrius Archyvų skyrius Centrinis viešųjų pirkimų ir koncesijų skyrius Daugiabučių namų administravimo ir renovavimo skyrius Dokumentų skyrius E. paslaugų ir informacinių technologijų skyrius Klientų aptarnavimo skyrius

Seniūnijos Aleksoto seniūnija Centro seniūnija Dainavos seniūnija Eigulių seniūnija Gričiupio seniūnija Panemunės seniūnija Petrašiūnų seniūnija Šančių seniūnija Šilainių seniūnija Vilijampolės seniūnija Žaliakalnio seniūnija

Centralizuotas vidaus audito skyrius Centrinis apskaitos skyrius Finansų ir ekonomikos skyrius Juridinių asmenų valdymo skyrius Nekilnojamojo turto skyrius Personalo valdymo skyrius Plėtros programų ir investicijų skyrius Ryšių su visuomene skyrius Teisės ir konsultavimo skyrius Užsienio ryšių skyrius